Jest to badanie inwazyjne polegające na pobraniu wycinka chorego narządu do dalszych badań histopatologicznych (bardzo istotne, aby wykluczyć zmiany nowotworowe), mikroelektronowych, immunofluorescencyjnych. Te badania, przy wykorzystaniu najnowszej techniki - mikroskopii elektronowej i komputerowej analizy danych - mogą być niezbędne, aby prawidłowo zaplanować dalsze leczenie.
U małych dzieci, do 4 roku życia, biopsja nerki jest wykonywana metodą otwartą, operacyjną. U starszych dzieci i dorosłych, którzy są już w stanie współpracować w czasie zabiegu, badanie wykonuje się metodą przezskórną. Jest to tzw. oligobiobsja nerki. Wykonuje się ją na czczo, w znieczuleniu miejscowym, pod osłoną antybiotyków. Powikłania po oligobiopsji nerek występują bardzo rzadko. Do powikłań, które mogą się zdarzyć należy krótkotrwały krwiomocz lub krwinkomocz, rzadziej - ropień nerki.
W niektórych przypadkach - zespołu nerczycowego, przedłużającego się kłębkowego zapalenia nerek, w pewnych przypadkach ostrej niewydolności nerek, długotrwałego białkomoczu lub krwinkomoczu niewiadomego pochodzenia - biopsja jest badaniem niezbędnym.
